Вебинар «Анализ качества FastQ-файлов и исправление ошибок»

W04
1490,00
р.
О вебинаре

Остались вопросы? Пишите на info@pcr.news

На вебинаре вы научитесь:
  • Пользоваться программой fastqc для оценки качества секвенирования и интерпретировать ее вывод.
  • Фильтровать сырые прочтения секвенатора по качеству и длине, отрезать адаптеры и праймерные последовательности. Мы будем работать с реальными данными секвенирования с платформы Illumina.
  • Устанавливать программу fastqc, запускать ее и анализировать получаемый отчет. На основании этого отчета мы сможем понять, насколько качественно было проведено секвенирование и какие манипуляции с прочтениями необходимо совершить для дальнейшей обработки данных.
  • Запускать программы cutadapt и prinseqlite. Мы разберем их настраиваемые параметры, чтобы фильтровать некачественные части прочтений и оставлять только те данные, с которыми дальше можно работать.



Аудитория

Вебинар будет полезен биологам, химикам, врачам и всем, кто хочет начать свой самостоятельный путь в обработке биологических данных.